微生物分類
 - 細菌分類
	- グラム陽性球菌
		- スタフィロコッカス属
			- 黄色ブドウ球菌
			- 表皮ブドウ球菌
		- ストレプトコッカス属
				- 溶血性レンサ球菌
				- アガラクチア菌
				- 肺炎球菌
				- 口腔レンサ球菌
		- エンテロコッカス属
			- 腸球菌
		- グラム陽性偏性嫌気性球菌群
	- グラム陽性桿菌
		- 有芽胞菌
			- バシラス属
				- 炭疽菌
				- セレウス菌
				- 枯草菌
			- クロストリジウム属
				- ウェルシュ菌
				- ボツリヌス菌
				- 破傷風菌
		- 無芽胞菌
			- リステリア属
				- リステリア
			- ユウバクテリウム属
			- コリネバクテリウム属
				- ジフテリア
			- ラクトバシラス属
				- デーデルライン桿菌
	- グラム陰性球菌（好気性）
		- ナイセリア属
			- 淋菌
			- 髄膜炎菌
		- モラクセラ属
	- グラム陰性桿菌（嫌気性）
		- 腸内細菌科
			- エシュリキア属
				- 大腸菌
			- シゲラ属
				- 赤痢
			- サルモネラ属
				- サルモネラ
				- チフス
			- クレブシエラ属
				- 肺炎桿菌
			- エルシニア属
				- ペスト
				- 腸炎エルシニア
			- セラチア属
		- モルガネラ科
			- モルガネラ属
			- プロテウス属
		- ハフニア科
			- ハフニア属
		- ビブリオ科
			- ビブリオ属
				- コレラ
				- 腸炎ビブリオ
		- エロモナス科
			- エロモナス属
		- パスツレラ科
			- パスツレラ属
			- ヘモフィルス属
				- インフルエンザ菌
		- レプトトリキア科
			- ストレプトバシラス属
	- グラム陰性桿菌（好気性）
		- シュードモナス属
			- 緑膿菌
		- アシネトバクター属
			- アシネトバクター
		- ボルデテラ属
			- 百日咳
		- レジオネラ属
			- レジオネラ
		- ブルセラ属
		- バルトネラ属
			- 塹壕熱
			- 猫引っ掻き症
		- フランセシラ属
			- 野兎病
		- コクシエラ属
			- Q熱
	- ラセン菌
		- スピロヘータ目
			- トレポネーマ属
				- 梅毒
		- レプトスピラ目
			- レプトスピラ属
				- レプトスピラ症
				- ワイル病
		- ブラキスピラ目
			- ブラスピキラ属
		- その他のラセン菌
			- カンピロバクター属
				- カンピロバクター
			- ヘリコバクター属
				- ピロリ菌
	- 放線菌（アクチノミセトータ：グラム陽性桿菌）
		- マイコバクテリウム属
			- 結核
			- らい菌
			- 非結核性抗酸菌
		- コリネバクテリウム属
		- アクチノミセス属
		- ノカルジア属
		- キューティバクテリウム
	- 寄生細菌
		- マイコプラズマ
		- リケッチア
			- ツツガムシ病
			- ロッキー山紅斑熱
		- クラミジア
			- 性器クラミジア
			- 肺炎クラミジア
			- オウム病

 - ウイルス分類
	- DNAウイルス
		- 二本鎖
			- エンベロープあり
				- ポックスウイルス
					- 天然痘
					- 牛痘
				- ヘルペスウイルス
					- 単純ヘルペスウイルス1型（HSV-1）
					- 単純ヘルペスウイルス2型（HSV-2）
					- 水痘ウイルス（VZV）
						- 水痘
						- 帯状疱疹
					- EBウイルス（EBV）
						- 伝染性単核球症
					- サイトメガロウイルス（CMV）
						- 巨細胞封入体症
					- ヒトヘルペスウイルス6B/7型（HHV-6B/7）
						- 突発性発疹
					- ヒトヘルペスウイルス8型（HHV-8）
						- カポジ肉腫
				- ヘパドナウイルス
					- B型肝炎ウイルス（HBV）
			- エンベロープなし
				- アデノウイルス
					- 咽頭結膜熱（プール熱）
					- 流行性角結膜炎
				- パピローマウイルス（HPV）
					- HPV-6/11（尖圭コンジローマ）
					- HPV-16/18（子宮頸癌）
				- ポリオーマウイルス
					- JCウイルス
						- 進行性多巣性白質脳症
		- 一本鎖
			- エンベロープなし
				- 	パルボウイルス
					- ヒトパルボウイルスB19
						- 伝染性紅斑（リンゴ病）
	- RNAウイルス
		- 一本鎖（ー）
			- エンベロープあり
				- パラミクソウイルス
					- 麻疹ウイルス（麻疹）
					- ムンプスウイルス（流行性耳下腺炎）
					- RSウイルス（かぜ症候群）
					- パラインフルエンザウイルス（かぜ症候群）
				- オルソミクソウイルス
					- インフルエンザウイルス（インフルエンザ）
				- ラブドウイルス
					- 狂犬病ウイルス（狂犬病）
				- アレナウイルス
					- ラッサウイルス（ラッサ熱）
					- マチュポウイルス（南米出血熱）
				- ブニヤウイルス
					- クリミアコンゴ出血熱ウイルス（クリミアコンゴ出血熱）
					- ハンタウイルス（腎症候性出血熱）
					- SFTSウイルス（重症熱性血小板減少症候群：SFTS）
				- フィロウイルス
					- エボラウイルス（エボラ出血熱）
					- マールブルグウイルス（マールブルグ熱）
		- 一本鎖（＋）
			- エンベロープあり
				- コロナウイルス
					- SARS
					- MERS
					- COVID-19（新型コロナウイルス感染症）
					- かぜ症候群
				- トガウイルス
					- 風疹ウイルス（風疹）
				- フラビウイルス
					-  HCV（C型肝炎）
					- 日本脳炎ウイルス（日本脳炎）
					- デングウイルス（デング熱）
					- ウエストナイルウイルス（ウエストナイル熱）
				- レトロウイルス
					- HIV（後天性免疫不全症候群：AIDS）
					- HTLV（成人T細胞白血病/リンパ腫：ATLL）
			- エンベロープなし
				- ピコルナウイルス
					- ポリオウイルス（急性灰白髄炎：ポリオ）
					- コクサッキーウイルス（ヘルパンギーナ、手足口病）
					- エンテロウイルス（手足口病）
					- ライノウイルス（かぜ症候群）
					- HAV（A型肝炎）
				- アストロウイルス
					- アストロウイルス（ウイルス性下痢症）
				- カリシウイルス
					- ノロウイルス（ウイルス性下痢症）
		- 二本鎖
			- エンペロープなし
				- レオウイルス
					- ロタウイルス（ウイルス性下痢症）

 - 寄生虫学
	- 原虫
		- 根足虫類（アメーバ類）
			- 赤痢アメーバ
		- 鞭毛虫類
			- 膣トリコモナス
			- ランブル鞭毛虫
			- トリパノソーマ
			- リーシュマニア
		- 胞子虫類
			- マラリア
			- クリプトスポリジウム
			- トキソプラズマ
		- 繊毛虫類
	- 蠕虫
		- 線虫
			- 回虫
			- 蟯虫
			- 鞭虫
			- 広東充血線虫
			- アニサキス
		- 吸虫
			- 日本住血吸虫
			- 肝吸虫
			- 横川吸虫
			- ウェステルマン肺吸虫
		- 条虫
			- 日本海裂頭条虫
			- 有鉤条虫
			- 無鈎条虫
			- 多包条虫

感染症分類（重複あり）
 - 全身感染症
 - 呼吸器感染症
 - 消化器感染症
 - 泌尿器感染症
 - 皮膚感染症
 - 神経感染症
 - 骨・関節感染症
 - 免疫不全関連感染症
 - 輸入感染症

感染症検査
 - 染色
 - 培養
	 - 培地

抗微生物薬
 - 抗菌薬
 - 抗ウイルス薬
 - 抗真菌薬
 -